Nel 1991 la Biblioteca Centrale del CNR, in seguito ad un accordo di convenzione stipulato con la Direzione Generale Informazione, Comunicazione e Cultura della Commissione Europea, è divenuta Biblioteca Depositaria della Commissione Europea (DEP). Nel corso del 2006 la Biblioteca Depositaria, con un nuovo accordo di convenzione, si è trasformata in Centro di Documentazione europea (CDE) ed è entrata a far parte di una rete che comprende 600 Centri in tutto il mondo, di cui 366 in Europa e 50 in Italia con lo scopo di promuovere la diffusione dell'informazione europea. In base alla convenzione, perviene in Biblioteca una copia delle pubblicazioni a stampa ed elettroniche, sia periodiche che monografiche, delle differenti istituzioni dell'Unione (Commissione, Consiglio, Parlamento, Corte di Giustizia, Comitato Economico e Sociale, Comitato delle Regioni, Banca Europea degli Investimenti, EUROSTAT) pubblicate dall'Ufficio delle Pubblicazioni Ufficiali dell'Unione Europea. Il CDE è dislocato presso la sala B della Biblioteca Centrale "G. Marconi" dove sono messe a disposizione dell'utente numerose banche dati europee e tutte le pubblicazioni, sia periodiche che monografiche, a scaffale aperto. Sono presenti, inoltre, terminali per accedere al sito dell'Unione europea e fare ricerche bibliografiche. Il CDE costituisce uno dei punti di servizio delle reti di informazione dell'Unione europea.
Le sue principali finalità sono:
- incentivare l'informazione, lo studio e l'acculturamento sulle attività e i valori dell'Unione Europea;
- contribuire, con lo scopo di accrescere la trasparenza, a far conoscere le politiche dell'Unione europea a tutti i cittadini europei (anche esterni al mondo universitario e della ricerca) e alle imprese;
- supportare le università e i centri di ricerca nella promozione e nello sviluppo dell'insegnamento e della ricerca sull'integrazione europea;
- offrire a studenti, studiosi, cittadini provenienti dal mondo del lavoro e delle professioni servizi integrati di informazione e documentazione sulle attività dell'Unione europea, attraverso la consultazione di basi dati e di differenti tipologie di documentazione;
- informare, in sinergia con le altre reti della Commissione, sulle politiche dell’Unione;
- conservare la documentazione provvedendo al suo ordinamento, alla catalogazione, indicizzazione e collocazione;
- diventare un punto chiave d’informazione sulle istituzione e le politiche dell’Unione europea all'interno dell'istituzione ospitante.